Новая структура репозитория + страницы про научные публикации (#19)

* New structure implemented.
List of journals added.

* New part for 'papers-with-code'

---------
Co-authored-by: ChrisLisbon <yulashka.htm@yandex.ru>

README.md

-# Open-source-ops by NSS Lab.
+# Open-source-ops (by NSS Lab).
 
 Этот репозиторий создан для хранения различных инструментов, скриптов, инструкций и руководств, 
 которые могут быть полезны при создании проектов с открытым исходным кодом.
 
-Для настройки инфраструктуры и CI/CD:
+## Основные разделы:
 
-- [Зеркалирование GitHub -> GitLab](/mirror_repo_to_gitlab.md);
+### [Инструкции](/tutorials)
+- [Зеркалирование GitHub -> GitLab](/tutorials/mirror_repo_to_gitlab.md);
+- [Мультиязычные README](/tutorials/create_multilang_readme_files.md).
 
-- [Мультиязычные README](/create_multilang_readme_files.md).
+### [Шаблоны](/templates)
 
-Чаты и каналы:
+TBD
 
-- [ITMO.Opensource](https://t.me/itmo_opensource);
-- [Open Source Россия](https://t.me/OpenSourceRu);
-- [Новости NSS Lab](https://t.me/NSS_group).
+### [Примеры](/best-practices)
 
-Выступления и мастер-классы:
+TBD
+
+### [Открытый код и наука](/science)
+
+- [Где опубликовать научную статью про OS-разработку?](/science/journals.md)
+
+### Чаты и каналы:
+
+От авторов репозитория:
+
+- [ITMO.Opensource](https://t.me/itmo_opensource) - чат про открытый код в науке;
+- [NSS Lab News](https://t.me/NSS_group) - новости нашей лаборатории.
+  
+Внешние:
+
+- [Open Source Россия](https://t.me/OpenSourceRu) - крупный канал про открытый код.
+
+### Выступления и мастер-классы:
 
 - Open-source meetup №1: [видео](https://aim.club/publications/scientific-open-source-meetup), 
-[презентации](https://disk.yandex.ru/d/mFybSAZIVEbe7w).
+[презентации](meetups/scios-meetup-1);
+
+- Open-source meetup №2: [call for speakers](https://aim.club/publications/scientific-open-source-meetup-2).
+
+
+### Благодарности:
+
+Репозиторий и связанные с ним активности финансируются Университетом ИТМО в рамках НИР магистров и аспирантов №622283
+"Технологии обеспечения качества научных проектов с открытым исходным кодом" (2022-2023).
+
+### См. также:
+
+- [aimclub](https://github.com/aimclub) - библиотеки и фреймворки в области AI/ML;
+- [ITMO-NSS-team](https://github.com/ITMO-NSS-team) - открытый код, связанный с научными разработками нашей лаборатории.
\ No newline at end of file

best-practices/README.md

+Списки примеров, иллюстрирующих "лучшие практики" в области разработки открытого ПО.
\ No newline at end of file

meetups/README.md

+Материалы с наших выступлений, посвященных открытому коду.
\ No newline at end of file

meetups/scios-meetup-1/README.md

+# Митап "Научный опенсорс" №1
+
+16 декабря на Кронверском, 49 состоялся 1-ый Scientific Open-Source Meetup - встреча с ИИ-разработчиками и учеными, развивающими направление открытого кода в ИТМО.
+
+На мероприятии собрались аспиранты, научные сотрудники и магистранты петербургских вузов, 
+а также представители IT-компаний. Слушатели из других городов присоединились к онлайн-трансляции.
+
+Открыл встречу Александр Бухановский, научный руководитель исследовательского центра “Сильный ИИ в промышленности". Он рассказал о демократизации искусственного интеллекта (ИИ) и о создании в ИТМО открытого программного обеспечения в области ИИ и смежных цифровых технологий. 
+
+[Николай Никитин](https://github.com/nicl-nno) рассказал о том, 
+зачем в целом делать научный код открытым и каких принципов стоит придерживаться, работая в этом направлении.
+
+Своим опытом работы над открытым репозиторием поделился [Александр Хватов](https://github.com/SuperSashka), руководитель лаборатории композитного ИИ (ЛабКИИ).
+
+Научный сотрудник ЛабКИИ [Юлия Борисова](https://github.com/ChrisLisbon) более подробно раскрыла вопрос код-ревью. 
+
+Кроме этого, во второй половине мероприятия была проанонсирована [программа менторства открытого кода](https://aim.club/publications/mentoringprogram) в ИТМО под эгидой исследовательского центра “Сильный ИИ в промышленности".
+
+Видео с мероприятия доступны по [ссылке](https://aim.club/publications/scientific-open-source-meetup).

science/README.md

+Советы по публикации воспроизводимых научных результатов, полностью или частично основанных на открытом коде.
\ No newline at end of file

science/journals.md

+# Где можно опубликовать научную статью про личный или коллективный open-source проект?
+
+## В области ИИ
+###  [Journal of Machine Learning Research](https://www.jmlr.org/mloss/) (Q1):
+   
+В секции "Machine Learning Open Source Software" публикации выходят в формате 4-страничных мини-статей.
+Требования к статьям включают популярность репозитория, выраженную в пользователях и звездочках, 
+активность сообщества и т.п.
+
+По нашему опыту - рецензии занимают до полу-года и обычно весьма подробны. 
+Исправления производятся в формате revise-and-resubmit.
+При этом замечания выдвигаются не только по научной составляющей, но и, например, по качеству документации.
+
+### [Papers With Code](https://paperswithcode.com/):
+
+Автоматический агрегатор статей в области AI/ML со ссылками на GitHub. 
+Критерии ранжирования - тематика (CV, NLP и т.д.) и число звездочек.
+  
+
+## Без привязки к области
+
+### [Journal of Open Research Software](https://openresearchsoftware.metajnl.com/) (Q2):
+
+Публикует полноразмерные статьи про научные библиотеки с "high reuse potential". 
+Также принимаются статьи про различные аспекты разработки и поддержки разработки открытого научного ПО в целом.
+
+
+### [Journal of Open Source Software](https://joss.theoj.org/) (без индексации):
+
+Менее формальный, но очень качественно реализованный "developer-friendly" журнал про open-source. 
+Вся деятельность ведется через GitHub - от [ревью](https://github.com/openjournals/joss-reviews/issues) до 
+[документации](https://joss.readthedocs.io/en/latest/) для авторов и рецензентов.
+Есть смысл почитать как минимум ради перенимания "хороших практик".
+
+### [SoftwareX](https://www.softxjournal.com/) (Q2)
+
+Open-Access журнал, публикующий статьи про научное ПО под открытой лицензией. 
+Под каждую публикацию создается репозиторий в [GitHub-е журнала](https://github.com/ElsevierSoftwareX).
\ No newline at end of file

templates/README.md

+Шаблоны и примеры файлов, которые могут пригодится при создании библиотек с открытым кодом.
\ No newline at end of file

mirror_repo_to_gitlab.md → tutorials/mirror_repo_to_gitlab.md

@@ -16,7 +16,7 @@
   - Введите ваш `access token` (его можно сгенерировать по [инструкции](https://docs.github.com/en/enterprise-server@3.4/authentication/keeping-your-account-and-data-secure/creating-a-personal-access-token), название может быть любым, срок действия обычно выставляют до одного года, среди `scopes` обязательно надо выбрать `repo`)
   - Найдите в списке ваш проект
   - Задайте рядом с ним вашу группу на GitLab (для проектов NSS Lab используйте [ITMO-NSS-team](https://gitlab.actcognitive.org/itmo-nss-team))
-    ![alt text](/images/gitlab_group.jpg)
+    ![alt text](/tutorials/images/gitlab_group.jpg)
   - Нажмите `Import`
 
 - Уберите ветку main из списка защищённых: